Die Film Version von Galaxy Express 999 ist fast identisch mit der original Story. Der Hauptunterschied besteht darin, dass die Geschichte etwas komprimiert wurde. Normalerweise besuchen sie über hundert Planeten, wie sie es im original Manga und der Serie getan haben, Tetsuro besucht nur vier....
Während einer angeblich einfachen Mission, bei der Joe und seine Crew die Funktion als Begleiter übernehmen, kommt es zu einem schlimmen Vorfall. Plötzlich verschwinden auf der Reise die Passagiere auf mysteriöse Weise. Die Dinge verschlimmern sich, als die United Space Force Joe der...
Der Film spielt zwei Jahre nach den Ereignissen des Vorgängers »Galaxy Express 999«. Die Erde ist mittlerweile nichts weiter als ein riesiges Schlachtfeld. Tetsuro ist älter geworden und bekämpft immer noch die Maschinenmenschen. An Bord des Galaxy Express wird er wieder mit Maetel vereint.
Auf der Erde leben, unerkannt unter den Menschen, 9 Cyborgs mit außergewöhnlichen Fähigkeiten. Einst haben sie gekämpft, doch nun sind sie frei und führen ein ungezwungenes Leben. Dies ändert sich allerdings als eines Tages ein fremdes Raumschiff auf der Erde notlandet. An Board ist nur noch...