Harry Walker, ein ehemaliger Militärflieger, wird zufällig Zeuge eines bewaffneten Überfalls auf einen gepanzerten Geldtransporter. Die drei bewaffneten Gangster erschießen die Wachen und nehmen eine junge Frau als Geisel. Harry nimmt mit seinem Hubschrauber die Verfolgung auf.
Das betuliche Vorstadtleben hat Pee-wee Herman (Paul Reubens) aufgegeben, er lebt nunmehr zurückgezogen auf einer Farm mit zahlreichen Tieren und einem botanischen Garten, in dem er mithilfe obskurer Substanzen u.a. Hot Dog-Bäume züchtet. Die Ortsansässigen scheinen von Pee-wees Anwesenheit...
Der Jungfernflug des ersten Überschallverkehrsflugzeug Amerikas steht kurz bevor. Doch den Reisenden steht ein Kampf ums Überleben bevor, da das Hydrauliksystem des Flugzeuges sabotiert wurde und ein Passagier einen gefährlichen Grippevirus mit an Bord gebracht hat. Hoch über den Wolken laufen...
