Der Film spielt vier Jahre nach dem Ende von The Nun und folgt Schwester Irene bei ihren Ermittlungen in einem Mordfall in einem Internat in Frankreich. Während ihrer Ermittlungen ist sie erneut gezwungen, sich der dämonischen Kraft Valak, der Nonne, zu stellen.
In Elenies Leben ist alles in bester Ordnung. Sie ist glücklich verheiratet, hat zwei bezaubernde Kinder und liebt ihren Hob als Zimmermödchen im Dionysos auf Naxos. Doch eines Tages stößt Eleni beim Aufräumen versehentlich eine Schachfigur einer noch nicht beendeten Partie um. Verlegen stellt...