Im von Aliens beherrschten feudalen Tokio erhält der junge Krieger Gintoki Sakata zwei Aufträge: Er soll einen fähigen Schwertkämpfer und gesuchten Terroristen aufspüren und das verfluchte Schwert Benizakura finden, damit dieses nicht in die falschen Hände gerät und für großes Unheil sorgt.
Das Mädchen Mary, das so unglücklich über seine roten Haare ist, folgt aus Neugier einem schwarzen Kater namens Tib in den Wald. Dieser führt sie zu einer seltsamen Blume. Ganz in der Nähe der Blume entdeckt Mary auch noch einen Besen. Ehe sie sich versieht, trägt dieser das überraschte...
Bei Tag ist sie eine gewöhnliche, süße Studentin. Bei Nacht hingegen ist sie eine Teilzeit-Auftragskillerin - und das schwierigste Ziel steht ihr noch bevor.
Auf einem königlichen Ball mit Aschenputtel wird Rotkäppchen plötzlich in einen mysteriösen Fall hineingezogen. Wird sie das Rätsel noch vor Mitternacht lösen können?