Sie ist wieder da, allerdings nicht alleine. Amelia die neuste Entwicklung einer Rüstungsfirma, basiert auf der Technologie von M3gan. Allerdings wird Amelia abtrünnig und nur die Wiedererweckte M3gan kann sie aufhalten.
Die Menschheit steht kurz vor dem Abgrund! Sechzehn Atomraketen steuern auf die USA zu und haben strategisch wichtige Ziele im Visier. Der brutale Angriff bedroht auch die abgelegene Raketenabfangstation von Captain JJ Collins (Elsa Pataky). Die hat vor kurzem erst ihren Traumjob im Pentagon...