Nach der Zerstörung von Nibelheim durch Sephiroth sind Zack und Cloud auf der Flucht vor Shinra Inc. Auf dem Weg zurück nach Midgar erinnern sie sich an die schrecklichen Ereignisse in Nibelheim und kämpfen gegen Shinra ums Überleben.
Eine Geschichte, die über eine schwierige Liebesbeziehung erzählt, da die Insassen von ihrem Mutterschiff getrennt wurden und nun ziellos im All treiben.
Mit einer gestohlenen Zeitmaschine entflieht Agino Jiro dem despotischen 25. Jahrhundert und landet im 20. Jahrhundert. Weil er eine Energiequelle für den weiteren Betrieb der Zeitmaschine benötigt, bemächtigt er sich in unserer Zeit eines Autos, zieht aber dabei unbeabsichtigt einige...