Während er die Habseligkeiten seiner kürzlich verstorbenen Tante Matsuko durchforstet, fügt Neffe Sho die entscheidenden Ereignisse zusammen, die Matsukos Leben in einer verzweifelten Tragödie versinken ließen.
33 Jahre nachdem das Monster Gamera im Kampf mit einer Gruppe Gyaos-Fledermäuse nicht nur sich selbst sondern auch seine Gegner vernichtete, findet der kleine Toru in einem leuchtenden Stein ein Ei. Schon bald schlüpft die kleine Schildkröte Toto, die seltsame Fähigkeiten entwickelt....