DDR, Januar 1990. Nach seiner Absetzung und dem Fall der Mauer sind Diktator Erich Honecker und seine Frau Margot praktisch obdachlos. Nur der evangelische Pfarrer Uwe Holmer und seine Familie, die wie viele andere unter dem tyrannischen Regime gelitten haben, bieten ihnen Zuflucht.
Erich Honecker, der zuvor mächtigste Mann der DDR, ist obdachlos und findet Zuflucht in einem Pfarrhaus. Die Dokumentation zu „Honecker und der Pastor“ begleitet den Regisseur und Schauspieler Jan Josef Liefers bei seinen Nachforschungen.